De kerkgeschiedenis van Den Helder kan niet los worden gezien van de geschiedenis van het nabijgelegen duindorp Huisduinen. Tot ongeveer de zeventiende eeuw was Huisduinen een dorp van Groenlandvaarders en commandeurs, terwijl Den Helder op dat moment slechts een nederzetting was. De enige kerk die Huisduinen nu nog heeft, doet niet meer dienst als kerk, maar is tegenwoordig een cultureel centrum en trouwlocatie. De kerk dateert uit 1851, maar dat betreft alleen de fundering. De houten kerk die in 1851 werd gebouwd, was in 1896 al aan vervanging toe, en dat is het huidige kerkgebouw. Het oudste onderdeel van de kerk is de klok, die dateert uit 1537, de periode van de Reformatie. De klok hing oorspronkelijk in de oude rooms-katholieke kerk, die destijds ongeveer op de plaats stond waar nu zandplaat de Razende Bol ligt.