Het kerkje aan de Steengracht is voor de christelijk gereformeerden in Den Helder nog steeds een plek vol herinneringen. Hier werd het beginsel van de Afscheiding uit 1834 voortgezet. Maar het gebouw verouderde, en er ontstond behoefte aan nieuwbouw. In 1993 werd een nieuwe kerk gebouwd aan de Fazantenstraat. De symboliek van het kruis op de voorgevel en het anker in de tuin, die de verbondenheid tussen de Bijbel en de zee symboliseren, leidde tot de naam: ‘t Kruisanker. Het kerkgebouw aan de Steengracht werd verkocht. Het oude raam boven de preekstoel van de Steengrachtkerk werd meegenomen en kreeg een plek in het nieuwe gebouw. Het interieur van de kerk werd verrijkt met veel modern houtsnijwerk van bijbelse symbolen.

Veel kerken binnen het kerkverband van de Christelijke Gereformeerde Kerken werken lokaal samen met de Gereformeerde Kerk Vrijgemaakt en/of de Nederlands Gereformeerde Kerk. Ook in Den Helder werd al jarenlang samengewerkt, wat heeft geleid tot een samengaan van de gemeenten. In 2023 vond bovendien de fusie plaats tussen de Gereformeerde Kerken vrijgemaakt en de Nederlands Gereformeerde Kerken. De naam van dit nieuwe kerkverband is Nederlandse Gereformeerde Kerken. Voor de gemeente betekent dit concreet dat er nu sprake is van één samenwerkingsgemeente, Christelijk Gereformeerd en Nederlands Gereformeerd. Sinds 2019 komt de gemeente samen in het kerkgebouw De Morgenster.